Le domaine de direction Opérations rassemble la douane et le Corps des gardes-frontière (Cgfr) qui opéraient dans les arrondissements douaniers et régions gardes-frontière. Ce regroupement et donc ce renforcement des activités opérationnelles est un pilier de la transformation de l'AFD en Office fédéral de la douane et de la sécurité des frontières (OFDF). Cela s'accompagne de la création du nouveau profil professionnel de spécialiste en douane et sécurité des frontières.
Structure régionale constituée de six niveaux régionaux: Le domaine de direction Opérations se compose des six régions suivantes (arrondissements douaniers et régions gardes-frontière):
- Douane Nord: Bâle-Ville, Bâle-Campagne, Argovie
- Douane Nord-est: Schaffhouse, Thurgovie, Zurich, Zoug, Schwyz, Lucerne, Obwald, Nidwald, Glaris
- Douane Est: Saint-Gall, Appenzell Rhodes-Intérieures, Appenzell Rhodes-Extérieures, Grisons, Principauté de Liechtenstein
- Douane Sud: Uri, Tessin
- Douane Ouest: Genève, Vaud, Valais
- Douane Centre: Jura, Neuchâtel, Berne, Fribourg, Soleure
