Der Direktionsbereich Operationen umfasst den Zoll und das Grenzwachtkorps (GWK) beziehungsweise die Zollkreise und Grenzwachtregionen. Diese Zusammenführung und damit Stärkung der operativen Tätigkeit ist ein Eckpfeiler der Weiterentwicklung der EZV zum Bundesamt für Zoll und Grenzsicherheit BAZG. Damit einher geht die Schaffung des neuen Berufsbilds Fachspezialist/in Zoll und Grenzsicherheit.
Regionalstruktur mit sechs Regionalebenen: Der Direktionsbereich Operationen ist in folgende sechs Regionen (Zollkreise und Grenzwachtregionen) gegliedert:
- Zoll Nord: Basel-Stadt, Basel-Landschaft, Aargau
- Zoll Nordost: Schaffhausen, Thurgau, Zürich, Zug, Schwyz, Luzern, Obwalden, Nidwalden, Glarus
- Zoll Ost: St. Gallen, Appenzell Innerrhoden, Appenzell Ausserrhoden, Graubünden, Fürstentum Liechtenstein
- Zoll Süd: Uri, Tessin
- Zoll West: Genf, Waadt, Wallis
- Zoll Mitte: Jura, Neuenburg, Bern, Freiburg, Solothurn